汇总：生物化学常用数据库、软件及下载链接

NCBI []

NCBI (National Center for Biotechnology Information）是指英国国立生物关键技术数据当中心

EMBL []

欧洲分子会生物学检验室EMBL（The European Molecular Biology Laboratory）

DDBJ []

DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年确立，是世界七大DNA 目录之一，与NCBI的GenBank，EMBL的EBI目录共同分成国际数间DNA目录

CNGB []

当近现代国家所目录（China National GeneBank）座落深圳大鹏从新区，是先于世界七大目录之后的当今世界第四大国家所级目录。它是当近现代首个，也是唯一一个国家所肽质库，相对当今世界另外三个肽质库而言，国家所肽质库样品保存的体量、存储量和可访问的图表量皆是当今世界最大。

BIGD []

当近现代国家所肽质组科学图表当中心 永生与生来时品质大图表当中心 (National Genomics Data Center BIG Data Center)

miRBase []

piRNAbank []

piRNAbank []

SILVA []

LncRNAdb []

细菌菌生物

LncRNAwiki [_Page]

人类长非编码器RNA目录

Rfam[]

类似于Pfam的RNA的王室译文目录

Human protein atlas [ ]

人体肽在细胞上皮细胞、该组织、病理前提下的表述

Pfam []

Pfam是肽质的王室的目录，之外采用显马尔可夫基本概念生成的译文和多氨基酸鉴定。

SwissProt []

手动译文的非冗余肽氨基酸目录

UniProt [ ]

PIR []

Antibodies []

BRENDA [ ]

HPRD []

InterPro []

通过整合多个肽具体目录，提供了一个方便的对肽氨基酸顺利进行特性译文的平台，之外对肽质的王室、骨架域、特性亚基的数据分析

iProClass []

PRF []

REBASE []

PDB []

通过检验量度的骨架

SCOP []

CATH []

PSI []

PROSITE []

最全面性

Pfam []

最从业者

ProDom []

CCD []

Prints []

SMART [ ]

TIGRFAM []

STRING []

DIP []

检验验证的肽分析化学键目录

BioGRID [] ：

IntAct [ ]

MapMan：一个特性强大的葡萄糖必需查看和校对软件

KEGG []

GO []

NCBI BioSystems []

IMP []

plantCyc []

MANET [ ]

MetaNetX [ ]

MataboLights []

HMDB []

YMDB []

ECMDB []

Planteome []

dbGaP []

IPPN []

GeneCard []

Gene Wiki[_Wiki ]

Blast []

Interproscan []，

WEGO []

KAAS []

FGENESH []

AUGUSTUS [ ]

GENESCAN []

GeneMark []

Glimmer []

Exon-Intron Graphic Maker []

根据候选肽质的外显子和内含子等数据画肽质骨架

Blastp [_TYPE=BlastSearchCompanyLINK_LOC=blasthome]

可因特网给予肽骨架域的译文和后方数据

ArrayExpress [ ]

图表来自EMBL的高通量特性肽质组学检验的图表；

BAR []

在图表分析肽质特性时，一般而言会参考肽质的表述模式，即肽质在植物学有所不同该组织有所不同受精中后期的表述丰度起因变化。通过因特网图表分析网站BAR对候肽质顺利进行表述图表分析。 是一个植物学生信图表分析教育资源网站，用该网站图表分析肽质表述时，不仅可以赢得肽质表述模式的热图，还可以赢得GIS的电子荧光图片，直觉展现肽质在植物学该组织当中的表述后方。

GSDS []

Gene Structure Display Server，基于肽质组译文文件画氨基酸肽质骨架等特性

ProtParam []

肽特点图表分析是指肽的一些物理化学和分析化学给定，如分子会量、等电点、和原子分成、消光乘积、同位素、不稳定乘积、脂肪氏族指数、胶体。这些给定，有助于顺利进行肽的具体克隆检验。比如在胃政治体制（大肠杆细菌、细菌等）表述和纯化用意肽时，需要考虑肽的分子会量、等电点、消光乘积、不稳定乘积和胶体等。在蛋白质来时检验当中，也需要根据这些给定优化检验政治体制。

Protscale []

肽的亲旨旨松主要由其侧链双键R，如果R只是H或是C、H两原素分成的话，都是旨水的，如果成份极性侧链双键，如-OH、-SH、-COOH、-NH2 等，则就是极性的（亲水的）。旨旨松有嘧啶、胺基酸、组氨酸、缬氨酸、丝氨酸、异丝氨酸、丙氨酸和蛋氨酸（甲硫氨酸）。旨旨松在肽质内部，在维持肽质的三级骨架上，蛋白质和基质、免疫球肽和抗原数间的分析化学键等各种非共价键的分子会紧密结合方面，具有重要起到。

TMHMM []

肽的一环上皮细胞骨架图表分析对于数据分析肽的亚细胞上皮细胞导向密切具体。如果具有一环上皮细胞骨架，肽很可能定座落细胞上皮细胞当中与上皮细胞具体的骨架，如细胞上皮细胞质上皮细胞、叶绿体上皮细胞或肝细胞上皮细胞等内上皮细胞该系统。此外，肽一环上皮细胞骨架图表分析对于肽特性图表分析也有一定的帮助。比如某肽很难一环上皮细胞骨架，但是亚细胞上皮细胞导向检验显示其可定座落上皮细胞具体骨架，这说明该肽可能通过其他上皮细胞导向肽招揽依然的。

SignalP []

岩接收器后方为接收器肽切出点，岩之前的氨基酸为接收器肽

接收器肽是指驱使从新化学合成的肽质向从新陈葡萄糖通路转移的短肽链，不常座落肽的N-尾端，督导把肽质驱使到有所不同上皮细胞骨架的亚细胞上皮动物细胞内。编码器从新陈葡萄糖肽的mRNA在翻译时首先化学合成N尾端的接收器肽，它被接收器肽识别肽(SRP)所识别，SRP将rRNA空投至肝细胞上，肝细胞上皮细胞上的 SPR 受体识别并与之紧密结合。从新化学合成肽在接收器肽驱使下到达肝细胞内凸，而接收器肽则在接收器酰蛋白质的起到下被切除。由于它的驱使，从高年级的就必须通过肝细胞上皮细胞进入凸内，最终被从新陈葡萄糖到胞外。在寄主细菌当中表述外源肽时，只用接收器肽驱使外源肽导向从新陈葡萄糖到胞外，更高肽可溶性，在原核表述该系统（大肠杆细菌、芽孢杆细菌等）和细菌菌表述该系统（如毕赤细菌）当中均有应用。

NetPhos []

KinasePhos-2.0 []

肽质甲状腺激素指由肽质激蛋白质催化的把 ATP 的酰基转移到底物肽质肽键（丝氨酸、苏氨酸、嘧啶）上的过程，或者在接收器起到下紧密结合 GTP（一般而言以 GTP 取代 GDP），是生物体内一种普通的调节方式也，在细胞上皮细胞接收器转导的过程当中起重要起到。在接收器达到时通过赢得一个或几个酰集团而被激来时，而在接收器增强时可去除这些集团，从而失去来时性。有时某个接收器肽甲状腺激素一般而言引致当中下游的肽依次起因甲状腺激素，形成甲状腺激素诱导反应。

二、生物数据学软件及下载重定向：

Clustal:

MEGA:

MAFFT:

Sequence Matrix:

PGDSpider:

DnaSP v6:

Arlequin:

MapMan：

PartitionFinder:

jModelTest:

IQ-TREE:

IQ-TREE因特网:

RaxmlGUI:

Mrbayes 3.2.7:

PhyloSuite:

BEAST:

Figtree:

Tracer:

PopART:

Network:

Structure:

CLUMMP:

Distruct:

Migrate-N:

Phylonet: 或